Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HMG20BQ9P0W2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMG20BQ9P0W2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms