Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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