Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC1Q9NRX5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms