Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMPRSS4Q9NRS4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms