Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARHGEF4Q9NR80 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARHGEF4Q9NR80 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms