Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3GLB2Q9NR46 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GLB2Q9NR46 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms