Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC31BQ9NQW1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC31BQ9NQW1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms