Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CABP2Q9NPB3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CABP2Q9NPB3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CABP2Q9NPB3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CABP2Q9NPB3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CABP2Q9NPB3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CABP2Q9NPB3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CABP2Q9NPB3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CABP2Q9NPB3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP2Q9NPB3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms