Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKRIP1Q9H875 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms