Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PARLQ9H300 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms