Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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