Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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HOXD1Q9GZZ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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HOXD1Q9GZZ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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HOXD1Q9GZZ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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HOXD1Q9GZZ0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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