Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
INO80BQ9C086 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms