Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TM6SF1Q9BZW5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM6SF1Q9BZW5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM6SF1Q9BZW5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms