Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM8Q9BZR9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms