Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EDEM3Q9BZQ6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDEM3Q9BZQ6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms