Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHMP4AQ9BY43 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4AQ9BY43 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms