Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BBS2Q9BXC9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS2Q9BXC9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms