Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSBP4Q9BWG4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms