Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MXD3Q9BW11 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MXD3Q9BW11 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms