Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRDL1Q9BU40 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRDL1Q9BU40 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms