Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FYCO1Q9BQS8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FYCO1Q9BQS8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms