Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA1CQ9BQE3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA1CQ9BQE3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA1CQ9BQE3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TUBA1CQ9BQE3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms