Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GAL3ST1Q99999 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GAL3ST1Q99999 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms