Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PIK3R4Q99570 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms