Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRAM1Q96QH2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRAM1Q96QH2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRAM1Q96QH2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms