Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPR78Q96P69 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GPR78Q96P69 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms