Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ARAP1Q96P48 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ARAP1Q96P48 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms