Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROD6Q96NK8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROD6Q96NK8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms