Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q96MF0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q96MF0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q96MF0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q96MF0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q96MF0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q96MF0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q96MF0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q96MF0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q96MF0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q96MF0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q96MF0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q96MF0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q96MF0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q96MF0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms