Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf85Q96MD7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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C9orf85Q96MD7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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C9orf85Q96MD7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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C9orf85Q96MD7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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C9orf85Q96MD7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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C9orf85Q96MD7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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C9orf85Q96MD7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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C9orf85Q96MD7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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C9orf85Q96MD7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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C9orf85Q96MD7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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C9orf85Q96MD7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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C9orf85Q96MD7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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C9orf85Q96MD7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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C9orf85Q96MD7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf85Q96MD7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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