Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms