Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf72Q96LT7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf72Q96LT7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms