Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SGCZQ96LD1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms