Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP47Q96K76 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms