Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZBED3Q96IU2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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