Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS4Q96HW7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS4Q96HW7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS4Q96HW7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS4Q96HW7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS4Q96HW7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS4Q96HW7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms