Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY4

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16Q96EY4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMA16Q96EY4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMA16Q96EY4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms