Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC10A4Q96EP9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms