Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EAF2Q96CJ1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EAF2Q96CJ1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms