Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF1Q96CC6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms