Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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CCDC74AQ96AQ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC74AQ96AQ1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CCDC74AQ96AQ1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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CCDC74AQ96AQ1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC74AQ96AQ1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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