Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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RABGGTAQ92696 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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RABGGTAQ92696 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RABGGTAQ92696 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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