Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF3AQ92664 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms