Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DNAAF4Q8WXU2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms