Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSPC1Q8WXF1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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