Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFT2D1Q8WV19 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms