Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHBDD1Q8TEB9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms