Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA18Q8TC71 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA18Q8TC71 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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