Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM58Q8NG06 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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